研究院由中国农科院、高密市高新技术产业发展服务中心、山东康乐尔生物科技有限公司、北京国康本草代谢研究院等发起，并制定《中医农业（高密）研究院章程》，经高密市批准（高政函【2021】420号）文件批准，于2021年9月3日成立的事业单位，主要致力于中医农业投入品研发、标准制定、农副产品认证、产品实验、生产、销售、培训、检测等工作。是座落在地方，为全国中医农业投入品研发及其产业化发展服务的综合性农业科研机构，担负着中医农业重大基础与应用基础研究、应用研究和植物源提取高新技术研究的任务，致力于解决中医农业发展中基础性、方向性、全局性、关键性的重大科技问题，在推动农业科技创新、服务地方经济、培养中医农业投入品高层次人才、促进国际国内科技交流合作等方面发挥重要作用。将富含创造、创新精神的传统文化转化为现实生产力，不断满足人民日益增长的现实消费需求。
中医农业（高密）研究院大力开展关键技术攻关、高技术研究及产业化、基础研究与应用基础研究，取得了一大批具有国际先进水平的重大科技成果。以植物源提取抑绿素、植物源提取碳点量子水溶肥、植物源提取根结线虫植物源提取肽线虫剂植物源提取大量元素水溶肥植物源提取抑制蚜虫剂植物源提取灭杀红蜘蛛剂等为代表的60多项科技成果，大幅度提高了我国农业生态无农残水平。
中医农业（高密）研究院坚持人才优先发展战略，不断吸引、聚焦中医农业科技人才，加强人才培训教育，逐步调整、完善人才培养政策措施，强化人才培养机制，造就了一支学科专业齐全、高层次人才集中、勇于开拓创新的科技人才队伍。中国农科院原副院长、中医农业首倡科学家章力建博士将应邀任该研究院首席科学家。研究植物次生代谢与环境的关系，可以从更深的层次发掘植物与环境的内在联系，为全面、深入认识植物与环境的相互关系提供新的研究途径，同时也有利于人类更有效、合理地利用植物的次生代谢产物（在中医农业研发中发挥重要作用）。
山东康乐尔生物科技有限公司创建于2018年，座落于高密市高新区工业园区。是一家集研发、生产、销售为一体的现代农业科技公司。基于ISM菌群的ESM生物反应器全植物多目标联产高值化利用技术，生产新一代农作物专用中草药提取碳量子水溶肥、植物源提取可乐素、植物源提取除草配剂（植物源提取抑绿素）。系列产品是中医理论结合现代农业高科技的农业产品，能有效补充农作物在生长过程中所需养份之重要元素，能促进作物吸收空气中的二氧化碳，提高作物光合作用之效率，积累作物生长所需的碳、氢、氧三大要素，有效吸收土壤中的氮、磷、钾等有机成分。并可减少使用化肥、农药，从而降低成本，提高产量。
康乐尔作为中国农科院科研成果转化单位，成立了事业单位科研机构“中医农业投入品研发中心”，组建了由中国农科院、农业经济与发展研究所、植物保护所、蔬菜花卉研究所、土壤所、区划所、国康本草代谢研究院等相关单位专家组成的专家委员会，研发技术人员107人（其中，高级研究员91人，中级16人）。康乐尔研发中心，是技术改造、创新、研发的核心，主要任务是为康乐尔系列中医农业投入品的技术进步服务，为康乐尔的可持续发展提供强劲生命力的后备中医农业投入品。
康乐尔目前在北京、海南、武汉设有三个研发点，两条中试提取线，一条年产五万吨大型提取线，生产的新一代农作物植物源提取碳量子液体有机肥料、植物源提取可乐素、植物源提取抑绿素等已投放市场，效果突出。